從法律角度來看，建設方(通常指甲方或發包方)對施工方(通常指乙方或承包方)的罰款行為及其在工程款中的扣除問題，需要明確以下幾點：

　　一、罰款與違約金的區別

　　首先，需要明確的是，罰款屬于行政處罰的一種，只能由行政執法部門依法實施。而建設方與施工方之間簽訂的是民事合同，雙方地位平等，因此建設方并不具備對施工方直接進行罰款的權力。在實際操作中，建設方對施工方的經濟處罰往往通過約定違約金的方式來實現。

　　二、違約金的約定與扣除

　　違約金的約定：

　　根據《中華人民共和國民法典》第五百八十五條，當事人可以約定一方違約時應當根據違約情況向對方支付一定數額的違約金，也可以約定因違約產生的損失賠償額的計算方法。因此，建設方與施工方可以在施工合同中明確約定違約金條款，以約束施工方的行為。

　　違約金的扣除：

　　當施工方出現違約行為時，建設方有權按照合同約定的違約金條款要求施工方支付違約金。這部分違約金可以在工程款中進行扣除。但需要注意的是，約定的違約金數額應當合理，不得過高或過低，否則可能無法得到法律的支持。如果約定的違約金過分高于造成的損失的，人民法院或者仲裁機構可以根據當事人的請求予以適當減少。

　　三、法律依據

　　《中華人民共和國民法典》第五百八十五條：關于違約金的約定及其調整的規定。

　　《中華人民共和國行政處罰法》第八條：明確罰款屬于行政處罰的一種，只能由行政執法部門依法實施。

　　四、實踐中的操作建議

　　明確合同條款：建設方與施工方在施工合同中應明確約定違約金條款，包括違約金的數額或計算方法，以確保在發生違約行為時有明確的依據進行扣款。

　　合理確定違約金數額：約定的違約金數額應當合理，既能體現對施工方違約行為的懲罰性，又不能過分高于實際損失，以避免不必要的法律糾紛。

　　保留相關證據：在施工過程中，建設方應保留與施工方違約行為相關的證據材料，以便在需要時能夠證明施工方的違約事實和扣款依據。

　　協商解決糾紛：如果雙方對施工方的違約行為及扣款事宜存在爭議，應首先通過協商方式解決糾紛。協商不成時，可依法通過仲裁或訴訟途徑解決。

　　綜上所述，建設方對施工方的經濟處罰不能直接以罰款的形式進行，而應通過約定違約金的方式來實現。這部分違約金可以在工程款中進行扣除，但需遵循相關法律法規的規定和合同的約定。